Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K8

ATP6V1D, V-type proton ATPase subunit D, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1DQ9Y5K8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1DQ9Y5K8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1DQ9Y5K8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1DQ9Y5K8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1DQ9Y5K8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1DQ9Y5K8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1DQ9Y5K8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1DQ9Y5K8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1DQ9Y5K8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms