Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D7

PAM16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAM16Q9Y3D7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAM16Q9Y3D7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAM16Q9Y3D7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms