Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHDC2Q9Y2U9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms