Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNRF3Q9ULT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNRF3Q9ULT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms