Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRXN1Q9ULB1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
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