Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP45Q9UL16 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms