Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO4Q9UKT5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms