Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms