Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MLH3Q9UHC1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms