Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms