Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM10Q9UDY6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM10Q9UDY6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms