Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3BQ9UBC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3BQ9UBC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms