Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC17A7Q9P2U7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC17A7Q9P2U7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC17A7Q9P2U7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms