Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP5Q9NZZ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms