Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYY1

IL20, Interleukin-20, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL20Q9NYY1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IL20Q9NYY1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL20Q9NYY1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms