Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARHL2Q9NY43 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms