Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms