Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL1Q9NSC2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms