Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUOX1Q9NRD9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms