Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRT2Q9NQ03 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms