Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGAP3Q9NP61 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms