Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE7BQ9NP56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE7BQ9NP56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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