Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN1Q9HCN4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN1Q9HCN4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms