Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP29Q9HBJ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP29Q9HBJ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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