Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELL3Q9HB65 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms