Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIN28AQ9H9Z2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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