Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRDE2Q9H7Z3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms