Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOJQ9H4E5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOJQ9H4E5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms