Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GANQ9H2C0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GANQ9H2C0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms