Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CIPCQ9C0C6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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