Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB6Q9BUF5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB6Q9BUF5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms