Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT11Q9BT88 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT11Q9BT88 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms