Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms