Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOK1Q9BRS2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK1Q9BRS2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms