Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms