Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMCHL2Q9BQD1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMCHL2Q9BQD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms