Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TREX2Q9BQ50 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TREX2Q9BQ50 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms