Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms