Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RETNLBQ9BQ08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RETNLBQ9BQ08 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms