Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYCBPQ99417 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms