Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A12Q96S37 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms