Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2Q96Q42 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms