Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH12Q96NR8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms