Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRC1Q96M27 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRC1Q96M27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms