Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CELF6Q96J87 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CELF6Q96J87 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms