Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BICD1Q96G01 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms