Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TVP23CQ96ET8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms