Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM4SF19Q96DZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM4SF19Q96DZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms