Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM63Q969Q1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM63Q969Q1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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