Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF1Q92879 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CELF1Q92879 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms